Словарь терминов

ВИРУС ГЕПАТИТА G, ВГС — Hepatitis G virus, HGV - возбудитель гепатита G . Вирус гепатита G, также как GBV-A, GBV-B, GBV-C и ВГС , относят к семейству Flaviviredae. Геном вируса представлен одноцепочечной РНК с позитивной полярностью. По своей организации геном ВГС подобен РНК ВГС т.е. структурные гены расположены у 5' области генома, а неструктурные у 3' конца. На обоих концах генома расположены нетранслируемые зоны. Протяженность РНК ВГС, в различных изолятах вируса колеблется от 9103 до 9392 нуклеотидов. Одна открытая рамка считывания несет информацию о вирусспецифическом полипептиде, состоящем из 2873-2910 аминокислотных остатков. Сравнение последовательностей геномов GBV-A, GBV-B, GBV-C и ВГG с ВГС продемонстрировало, что их РНК не обладает более чем 32% идентичности, подтверждая тем самым постулат о самостоятельности этих вирусов. Известно, что на 5' и 3' - нетранслируемых регионах вирусного генома имеются элементы, необходимые для регуляции жизнедеятельности вируса. Исследования по анализу последовательностей дали противоречивые результаты. Так, при клонировании крайних 5' последовательностей этих участков двух вирусных изолятов из Америки и одного из Западной Африки не удалось обнаружить такие элементы. Стартовый кодон (AUG) инициации вирусного полипротеина расположен в позиции 552 (нумерация по изоляту PNF2161) вблизи от начала Е1 региона РНК. Установлено, что происходящие в У - регионе вставки и выпадения нуклеиновых кислот сдвигают открытую рамку считывания РНК ВГG, приводя к появлению дефектного "core" белка или возможно полного его отсутствия. Эти результаты позволили высказать предположение о использовании ВГG капсидных белков других, возможно еще неоткрытых , вирусов или же клеточных белков, выполняющих в данном случае роль структурных полипротеинов. После определения полной последовательности нуклеиновых кислот РНК ВГG оказалось, что в отличие от РНК ВГС в Е1 и Е2 регионе отсутствует гипервариабельная область. Было высказано предположение об отсутствии главных генотипов. Существование же генотипов возможно на уровне суптипов и изолятов. Вопрос о генотипах GBV-C и ВГС остается по-прежнему открытым, а опубликованные данные по анализу различных изолятов вируса противоречивы. Тем не менее высказывается предположение о наличии как минимум 3-х генотипов и нескольких субтипов вируса. По данным И. Мушавар с соавт., изоляты из Западной Африки относят к 1 генотипу, в котором выделяются два субтипа - 1а и 2b , в Европе и Северной Америке чаще удается выявить генотип 2а и 2b, а в Азии -3. Исследование генетической гетерогенности 354 нуклеотидного фрагмента 5'-нетранслируемого региона ВГG, в 42 изолятах вируса из 14 стран (в том числе России), выявило два уровня геномной вариабельности:на уровне индивидуальной инфекции и уровне изолята. Исследование неструктурного региона РНК ВГО и экспериментальное экспрессирование кодированных им белков определило наличие пяти белков, информация о которых находится в зонах NS2, NS3, NS4b, NS5a и NS5b.< Их вес находится в пределах от 20х10 3 до 70х10 3 дальтон. Эти белки выполняют функции: протеазы, хеликазы и РНК-зависимой РНК-полимеразы. Представляют интерес данные, полученные при изучении плавучей плотности частиц ВГО в градиенте сахарозы до и после их обработки неионном детергентом - "Твин-80", позволившие предположить наличие липидной оболочки у вируса. Ассоциация ВГG с липидами может мешать взаимодействию с антителами во время персистенции вируса. Основным маркером, применяемым для выявления вируса гепатита G, диагностики и изучения эпидемиологии гепатита G, является PHK-OBV-C/HOV, выявляемая методом амплификации с предварительным этапом обратной транскрипции (RT-PCR), при которой синтезируется кДНК. Для синтеза олигонуклеотидных праймеров использовали информацию о последовательностях участка РНК, кодирующего хеликазу (NS3). Этот выбор был сделан из-за высокой консервативности (83-99%) данного региона в различных изолятах вируса. Однако дальнейшие исследования выявили, что при тестировании некоторых образцов могут отмечаться ложнонегативные результаты, несмотря на наличие в них возбудителя. Учитывая это, для конструирования диагностикумов дополнительно стали использовать праймеры, информация о которых закодирована в 5' нетранслируемом регионе PHK-GBV-C/HGV. В настоящее время фирмами "Boehringer Mannheim GmbH" ("Бёрингер Манхейм") и "Abbott" ("ЭББОТТ") выпускаются диагностикумы для выявления РНК - методом RT-PCR. В первом из них используются праймеры из 5'нетранслируемом и NS5a региона. Учет результатов проводится в ИФА с помощью биотин- авидинового комплекса. Диагностикум обладает высокой чувствительностью - 8х10 2 . В диагностикуме фирмы "ЭББОТТ" применена лигазная технология проведения PCR ("Abbott Lex Probe System"). Оба диагностикума пока рекомендованы только для научных исследований. В большинстве лабораторий мира применяются самостоятельно изготовленные препараты, что определяет расхождение результатов тестирования. Проведенный во Франции внешний контроль качества исследований РНК GBV-C/HGV (21 лаборатория) выявил, что эти расхождения прежде всего определялись различиями в чувствительности применяемых препаратов (в 7 лабораториях чувствительность составляла 38-77%). По аналогии с гепатитом С большие надежды связывали с выявлением антител к GBV-C/HGV. Основой для разработки диагностических препаратов стала информация о антигенных эпитопах, кодированных РНК GBV-C. В качестве вирусного антигена был использован оболочечный антиген Е2, возможно представляющий собой главную мишень для гуморального иммунитета. Участок РНК, кодирующий Е2 антиген, был клонирован и введен в клетки яичника китайского хомячка (СНО), которые продуцировали антиген. При помощи аффинной хроматографии проводили очистку Е2 антигена и использовали при конструировании ИФА-диагностикума, предназначенного для выявления анти-Е2. Исследование сывороток крови, полученных от больных гепатитом и здоровых лиц, выявило, что в подавляющем большинстве случаев позитивный результат обнаружения анти-Е2 был отмечен при отсутствии PHK-GBV-C/HGV. Эти данные свидетельствуют, что в отличие от гепатита С, выявление антител при гепатите G не может быть использовано для поиска вирусоносителей, а пригодно для регистрации уже прошедшей инфекции и проведения эпидемиологических исследований для оценки распространения инфекции в различных группах населения.